Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLDN3O15551 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN3O15551 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN3O15551 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLDN3O15551 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLDN3O15551 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN3O15551 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms