Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC4O15439 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC4O15439 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC4O15439 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC4O15439 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC4O15439 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC4O15439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC4O15439 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC4O15439 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC4O15439 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC4O15439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC4O15439 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC4O15439 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms