Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHADO15335 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHADO15335 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHADO15335 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHADO15335 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHADO15335 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHADO15335 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHADO15335 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHADO15335 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHADO15335 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHADO15335 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHADO15335 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHADO15335 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHADO15335 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHADO15335 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHADO15335 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHADO15335 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHADO15335 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHADO15335 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHADO15335 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHADO15335 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHADO15335 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHADO15335 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHADO15335 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHADO15335 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHADO15335 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHADO15335 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHADO15335 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHADO15335 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHADO15335 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHADO15335 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHADO15335 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHADO15335 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHADO15335 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHADO15335 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHADO15335 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHADO15335 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHADO15335 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHADO15335 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHADO15335 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHADO15335 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHADO15335 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHADO15335 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHADO15335 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHADO15335 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHADO15335 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHADO15335 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHADO15335 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHADO15335 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHADO15335 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHADO15335 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHADO15335 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHADO15335 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHADO15335 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHADO15335 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHADO15335 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHADO15335 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHADO15335 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHADO15335 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHADO15335 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHADO15335 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHADO15335 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHADO15335 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHADO15335 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHADO15335 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHADO15335 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHADO15335 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHADO15335 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHADO15335 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHADO15335 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHADO15335 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHADO15335 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHADO15335 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHADO15335 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHADO15335 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHADO15335 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHADO15335 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHADO15335 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHADO15335 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHADO15335 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHADO15335 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHADO15335 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHADO15335 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHADO15335 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHADO15335 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHADO15335 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHADO15335 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHADO15335 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHADO15335 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHADO15335 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHADO15335 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHADO15335 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHADO15335 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHADO15335 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHADO15335 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHADO15335 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHADO15335 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms