Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK1O15075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DCLK1O15075 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCLK1O15075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK1O15075 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
DCLK1O15075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK1O15075 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK1O15075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DCLK1O15075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCLK1O15075 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK1O15075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK1O15075 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCLK1O15075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms