Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms