Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDC80O14777 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDC80O14777 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDC80O14777 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDC80O14777 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDC80O14777 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDC80O14777 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDC80O14777 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NDC80O14777 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDC80O14777 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDC80O14777 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDC80O14777 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDC80O14777 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDC80O14777 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDC80O14777 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDC80O14777 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDC80O14777 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDC80O14777 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDC80O14777 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDC80O14777 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NDC80O14777 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDC80O14777 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NDC80O14777 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDC80O14777 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDC80O14777 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDC80O14777 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDC80O14777 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDC80O14777 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDC80O14777 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDC80O14777 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDC80O14777 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDC80O14777 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDC80O14777 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDC80O14777 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDC80O14777 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDC80O14777 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDC80O14777 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDC80O14777 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDC80O14777 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDC80O14777 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NDC80O14777 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDC80O14777 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDC80O14777 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDC80O14777 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDC80O14777 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDC80O14777 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDC80O14777 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDC80O14777 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDC80O14777 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDC80O14777 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDC80O14777 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDC80O14777 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDC80O14777 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NDC80O14777 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDC80O14777 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDC80O14777 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDC80O14777 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDC80O14777 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDC80O14777 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDC80O14777 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDC80O14777 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDC80O14777 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDC80O14777 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDC80O14777 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDC80O14777 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDC80O14777 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDC80O14777 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDC80O14777 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDC80O14777 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDC80O14777 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDC80O14777 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDC80O14777 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NDC80O14777 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NDC80O14777 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDC80O14777 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDC80O14777 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDC80O14777 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NDC80O14777 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NDC80O14777 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NDC80O14777 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NDC80O14777 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDC80O14777 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDC80O14777 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDC80O14777 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms