Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC9O14530 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC9O14530 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC9O14530 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC9O14530 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNDC9O14530 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC9O14530 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms