Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epha8O09127 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha8O09127 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epha8O09127 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha8O09127 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Epha8O09127 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epha8O09127 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha8O09127 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Epha8O09127 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha8O09127 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha8O09127 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha8O09127 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epha8O09127 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Epha8O09127 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha8O09127 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha8O09127 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Epha8O09127 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha8O09127 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Epha8O09127 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Epha8O09127 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Epha8O09127 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epha8O09127 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epha8O09127 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epha8O09127 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epha8O09127 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epha8O09127 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epha8O09127 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epha8O09127 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Epha8O09127 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epha8O09127 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epha8O09127 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epha8O09127 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epha8O09127 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epha8O09127 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms