Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mesp2O08574 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mesp2O08574 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mesp2O08574 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mesp2O08574 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mesp2O08574 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms