Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR6O00574 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR6O00574 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR6O00574 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR6O00574 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR6O00574 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR6O00574 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR6O00574 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR6O00574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR6O00574 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CXCR6O00574 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR6O00574 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms