Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARNTLO00327 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARNTLO00327 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARNTLO00327 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARNTLO00327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARNTLO00327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARNTLO00327 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARNTLO00327 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARNTLO00327 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARNTLO00327 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARNTLO00327 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARNTLO00327 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARNTLO00327 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ARNTLO00327 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARNTLO00327 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARNTLO00327 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARNTLO00327 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARNTLO00327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms