Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF4O00268 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF4O00268 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF4O00268 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF4O00268 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF4O00268 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF4O00268 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF4O00268 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF4O00268 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF4O00268 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF4O00268 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF4O00268 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF4O00268 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF4O00268 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF4O00268 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF4O00268 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF4O00268 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF4O00268 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF4O00268 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF4O00268 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF4O00268 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF4O00268 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF4O00268 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF4O00268 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF4O00268 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF4O00268 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF4O00268 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF4O00268 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF4O00268 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF4O00268 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF4O00268 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF4O00268 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF4O00268 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF4O00268 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF4O00268 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4O00268 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4O00268 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF4O00268 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4O00268 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4O00268 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4O00268 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF4O00268 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4O00268 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4O00268 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF4O00268 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4O00268 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4O00268 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF4O00268 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF4O00268 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF4O00268 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF4O00268 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4O00268 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF4O00268 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4O00268 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF4O00268 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF4O00268 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF4O00268 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4O00268 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4O00268 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4O00268 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF4O00268 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4O00268 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4O00268 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF4O00268 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4O00268 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF4O00268 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4O00268 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4O00268 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4O00268 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4O00268 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF4O00268 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4O00268 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4O00268 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4O00268 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4O00268 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4O00268 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4O00268 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4O00268 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4O00268 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4O00268 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4O00268 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4O00268 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4O00268 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4O00268 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF4O00268 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF4O00268 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4O00268 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4O00268 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4O00268 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms