Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEN1O00255 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEN1O00255 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEN1O00255 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEN1O00255 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEN1O00255 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEN1O00255 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEN1O00255 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEN1O00255 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEN1O00255 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEN1O00255 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEN1O00255 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEN1O00255 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEN1O00255 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEN1O00255 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEN1O00255 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEN1O00255 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEN1O00255 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEN1O00255 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEN1O00255 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEN1O00255 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEN1O00255 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEN1O00255 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEN1O00255 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEN1O00255 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEN1O00255 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEN1O00255 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEN1O00255 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEN1O00255 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEN1O00255 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEN1O00255 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEN1O00255 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEN1O00255 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEN1O00255 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEN1O00255 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEN1O00255 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEN1O00255 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEN1O00255 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEN1O00255 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEN1O00255 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEN1O00255 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEN1O00255 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEN1O00255 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEN1O00255 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEN1O00255 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MEN1O00255 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEN1O00255 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEN1O00255 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEN1O00255 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MEN1O00255 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEN1O00255 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEN1O00255 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEN1O00255 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEN1O00255 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEN1O00255 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEN1O00255 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEN1O00255 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEN1O00255 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEN1O00255 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEN1O00255 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEN1O00255 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEN1O00255 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEN1O00255 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEN1O00255 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEN1O00255 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEN1O00255 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEN1O00255 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEN1O00255 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEN1O00255 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEN1O00255 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEN1O00255 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEN1O00255 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEN1O00255 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEN1O00255 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEN1O00255 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MEN1O00255 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEN1O00255 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEN1O00255 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEN1O00255 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEN1O00255 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MEN1O00255 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEN1O00255 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEN1O00255 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEN1O00255 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEN1O00255 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms