Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO1FO00160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1FO00160 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYO1FO00160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYO1FO00160 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYO1FO00160 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1FO00160 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1FO00160 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms