Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf4bG5E8Z2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf4bG5E8Z2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf4bG5E8Z2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf4bG5E8Z2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Taf4bG5E8Z2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf4bG5E8Z2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf4bG5E8Z2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf4bG5E8Z2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Taf4bG5E8Z2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms