Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2210016F16RikG3X8U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
2210016F16RikG3X8U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
2210016F16RikG3X8U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2210016F16RikG3X8U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
2210016F16RikG3X8U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
2210016F16RikG3X8U3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2210016F16RikG3X8U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms