Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd5G3UW60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Susd5G3UW60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd5G3UW60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd5G3UW60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd5G3UW60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Susd5G3UW60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Susd5G3UW60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Susd5G3UW60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Susd5G3UW60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Susd5G3UW60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Susd5G3UW60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Susd5G3UW60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd5G3UW60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd5G3UW60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd5G3UW60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms