Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21977F6U3N7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21977F6U3N7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm21977F6U3N7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21977F6U3N7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21977F6U3N7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21977F6U3N7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21977F6U3N7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21977F6U3N7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21977F6U3N7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21977F6U3N7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21977F6U3N7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21977F6U3N7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21977F6U3N7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 381.6 ms