Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf212F6TQD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf212F6TQD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf212F6TQD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf212F6TQD1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf212F6TQD1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms