Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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