Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227AF5H4B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227AF5H4B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM227AF5H4B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227AF5H4B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms