Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc6F2Z461 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc6F2Z461 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc6F2Z461 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Herc6F2Z461 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc6F2Z461 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc6F2Z461 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc6F2Z461 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms