Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raph1F2Z3U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Raph1F2Z3U3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Raph1F2Z3U3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Raph1F2Z3U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Raph1F2Z3U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Raph1F2Z3U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Raph1F2Z3U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms