Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzd7E9Q9W7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd7E9Q9W7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd7E9Q9W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdzd7E9Q9W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd7E9Q9W7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd7E9Q9W7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd7E9Q9W7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms