Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc74aE9Q9U8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc74aE9Q9U8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms