Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17728E9Q5K2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17728E9Q5K2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm17728E9Q5K2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm17728E9Q5K2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17728E9Q5K2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17728E9Q5K2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17728E9Q5K2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms