Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Galntl6E5D8G1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Galntl6E5D8G1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Galntl6E5D8G1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Galntl6E5D8G1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Galntl6E5D8G1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Galntl6E5D8G1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Galntl6E5D8G1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms