Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wscd2D4PHA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wscd2D4PHA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wscd2D4PHA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wscd2D4PHA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wscd2D4PHA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms