Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms