Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif28pD3YXS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif28pD3YXS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif28pD3YXS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif28pD3YXS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif28pD3YXS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif28pD3YXS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms