Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprbB2RU80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprbB2RU80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprbB2RU80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprbB2RU80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprbB2RU80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprbB2RU80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprbB2RU80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms