Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skint2A7XUX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skint2A7XUX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skint2A7XUX6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skint2A7XUX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skint2A7XUX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skint2A7XUX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint2A7XUX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skint2A7XUX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skint2A7XUX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skint2A7XUX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint2A7XUX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms