Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC169A6NNP5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC169A6NNP5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC169A6NNP5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC169A6NNP5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC169A6NNP5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC169A6NNP5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms