Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM23A6NLE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM23A6NLE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMIM23A6NLE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM23A6NLE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM23A6NLE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM23A6NLE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMIM23A6NLE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms