Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMP2A6NFY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMP2A6NFY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMP2A6NFY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMP2A6NFY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEMP2A6NFY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEMP2A6NFY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms