Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKUB1A6NFN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKUB1A6NFN9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKUB1A6NFN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKUB1A6NFN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKUB1A6NFN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKUB1A6NFN9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms