Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HELTA6NFD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HELTA6NFD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HELTA6NFD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HELTA6NFD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms