Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC182A6NF36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC182A6NF36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC182A6NF36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC182A6NF36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC182A6NF36 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms