Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD3L4A6NDZ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3L4A6NDZ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3L4A6NDZ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3L4A6NDZ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3L4A6NDZ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3L4A6NDZ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms