Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL33A6NCF5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL33A6NCF5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL33A6NCF5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL33A6NCF5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL33A6NCF5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL33A6NCF5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms