Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC78A2IDD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC78A2IDD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC78A2IDD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC78A2IDD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms