Protein–RNA interactions for Protein: A1A546

Isx, Intestine-specific homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IsxA1A546 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IsxA1A546 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IsxA1A546 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IsxA1A546 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IsxA1A546 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IsxA1A546 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IsxA1A546 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IsxA1A546 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IsxA1A546 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IsxA1A546 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IsxA1A546 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IsxA1A546 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IsxA1A546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IsxA1A546 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IsxA1A546 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IsxA1A546 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms