Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRGMA1A4Y4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRGMA1A4Y4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRGMA1A4Y4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRGMA1A4Y4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms