Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc112A0AUP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc112A0AUP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc112A0AUP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc112A0AUP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc112A0AUP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc112A0AUP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc112A0AUP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc112A0AUP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc112A0AUP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms