Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBC2A0A5B9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBC2A0A5B9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBC2A0A5B9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBC2A0A5B9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC2A0A5B9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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