Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
A0A0J9YXV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0J9YXV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms