Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY24

Ighv1-24, Immunoglobulin heavy variable V1-24 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-24A0A0A6YY24 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ighv1-24A0A0A6YY24 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv1-24A0A0A6YY24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms