Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28360A0A087WR25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28360A0A087WR25 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28360A0A087WR25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm28360A0A087WR25 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28360A0A087WR25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28360A0A087WR25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28360A0A087WR25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm28360A0A087WR25 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm28360A0A087WR25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28360A0A087WR25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28360A0A087WR25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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