Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B020011L13RikA0A087WQI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B020011L13RikA0A087WQI7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B020011L13RikA0A087WQI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020011L13RikA0A087WQI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms