Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
1700019A02RikA0A087WPV9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
1700019A02RikA0A087WPV9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
1700019A02RikA0A087WPV9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms